Ως «Γενοκτονία και μεγάλη καταστροφή» χαρακτήρισε ο προκαθήμενος της Ρωμαιοκαθολικής Εκκλησίας Πάπας Φραγκίσκος τη μαζική δολοφονία των Αρμενίων το 1915. Κατά την επίσκεψή του στην πρωτεύουσα της Αρμενίας Ερεβάν δήλωσε: «Αυτή η τραγωδία, αυτή η Γενοκτονία, έχει δυστυχώς σημαδέψει το ξεκίνημα μιας θλιβερής σειράς μεγάλων καταστροφών κατά τον προηγούμενο αιώνα». Σχολιάζοντας το ταξίδι του Πάπα Φραγκίσκου στην Αρμενία και τη σαφή αναφορά του στη Γενοκτονία, ο αντιπρόεδρος της τουρκικής κυβέρνησης Νουρετίν Τσανικλί δήλωσε ότι «πρόκειται για ατυχείς δηλώσεις», οι οποίες δείχνουν πως «ακόμη υφίστανται στοιχεία μιας νοοτροπίας σταυροφοριών, δεν χαρακτηρίζονται από ουδετερότητα και δεν περιγράφουν την πραγματικότητα».
Απαντώντας, ο επικεφαλής του γραφείου Τύπου του Βατικανού, πατέρας Φεντερίκο Λομπάρντι, τόνισε ότι «αν διαβάσει κανείς με προσοχή τις δηλώσεις του Πάπα, θα δει ότι δεν υπάρχει τίποτα που να σχετίζεται με πνεύμα σταυροφορίας». Πρόσθεσε δε ότι «ο Πάπας δεν κάνει σταυροφορίες, δεν προάγει πολέμους, αλλά προάγει την ειρήνη».
Η Τουρκία είχε αντιδράσει οργισμένα και πέρυσι, όταν ο Ποντίφικας στη διάρκεια λειτουργίας στη Βασιλική του Αγίου Πέτρου είχε δηλώσει ότι οι σφαγές των Αρμενίων «θεωρούνται η πρώτη Γενοκτονία του 20ού αιώνα». Τότε η Αγκυρα, σε ένδειξη διαμαρτυρίας, είχε ανακαλέσει τον πρεσβευτή της από το Βατικανό.
Οι σχέσεις τους παραμένουν ψυχρές έως σήμερα, και μάλιστα σε μια χρονική συγκυρία που η Αγία Εδρα είναι απορροφημένη από τη δεινή θέση των χριστιανών στη Μέση Ανατολή, ένα θέμα στο οποίο η Τουρκία είναι παίκτης-κλειδί.
