Το Τριμελές Εφετείο Πλημμελημάτων αποφάσισε ομόφωνα την ενοχή του ιδρυτή της οργάνωσης «Κιβωτός του Κόσμου» π. Αντώνη Παπανικολάου και τεσσάρων από τους έξι συγκατηγορούμενους του. Ο επικεφαλής της οργάνωσης κρίθηκε ένοχος για βαριά σωματική βλάβη σε βάρος ανηλίκων σε δομή του Βόλου, για ηθική αυτουργία σε επικίνδυνη σωματική βλάβη εναντίον ανηλίκων σε δομή του Βόλου και για απλή σωματική βλάβη σε βάρος καταγγελλόντων για καταναγκαστική, εξαντλητική εργασία, και απομόνωση ανήλικων παιδιών, όσο αυτά διέμεναν σε δομές του Κολωνού, της Καλαμάτας και του Βόλου.
Η απόφαση ενοχής του Εφετείου σε ό,τι αφορά τον πατέρα Αντώνιο περιλαμβάνει τις 9 από τις 19 πράξεις του κατηγορητηρίου. Σε πρώτο βαθμό ο κατηγορούμενος είχε καταδικαστεί για πέντε πράξεις.
Παράλληλα ενοχή αποφάσισαν οι εφέτες και για τέσσερις συνεργάτες του ιδρυτή της οργάνωσης, εργαζόμενους και στελέχη της Κιβωτού, οι οποίοι καταδικάστηκαν ανά περίπτωση για πράξεις βαριάς σωματικής βλάβης, επικίνδυνης σωματικής βλάβης, απλής σωματικής βλάβης, απειλής και έκθεσης.
Οι εφέτες απάλλαξαν πλήρως από τις κατηγορίες, δύο κατηγορούμενους. Μεταξύ εκείνων που κηρύχθηκαν ένοχοι είναι πρώην μέλος του ΔΣ της Κιβωτού, ο πρώην υπεύθυνος παιδαγωγών Βόλου και η πρώην διευθύντρια της δομής Βόλου.


