Οργισμένη αντίδραση φέρεται ότι είχε η Γερμανίδα καγκελάριος για το ενδεχόμενο να μετατρέψει η τουρκική κυβέρνηση του Ταγίπ Ερντογάν την Αγία Σοφία σε τζαμί. Την πληροφορία μετέδωσε το γερμανικό Καθολικό Πρακτορείο Ειδήσεων (ΚΝΑ) και αναπαρήγαγε η Deutsche Welle, σε σχετικό δημοσίευμα στο οποίο ακόμη αναφέρεται ότι η Γερμανίδα καγκελάριος χαρακτήρισε την πρόθεση του Ταγίπ Ερντογάν απαράδεκτη. Η υπόθεση της Αγίας Σοφίας αποτέλεσε θέμα, εξάλλου, και στη συνάντηση που είχε ο Οικουμενικός Πατριάρχης με τη Γερμανίδα καγκελάριο. Ωστόσο, εάν η καγκελάριος έκανε αυτές τις δηλώσεις, η θέση της είναι πολύ πιο κατηγορηματική από την επίσημη θέση που πήρε το γερμανικό υπουργείο Εξωτερικών. Στην καθιερωμένη ενημέρωση των δημοσιογράφων από τον κυβερνητικό εκπρόσωπο, η οποία διεξαγόταν την ίδια περίπου ώρα με τη συνάντηση των κ. Μέρκελ και Βαρθολομαίου, η αναπληρώτρια εκπρόσωπος του υπουργείου Σαουσάν Σεμπλί δήλωνε ότι ναι μεν το σημερινό καθεστώς της Αγίας Σοφίας ως μουσείο «ικανοποιεί όλους» συγχρόνως, όμως διαβεβαίωνε ότι «η τελική απόφαση ανήκει στην Τουρκία».
Το θέμα, πάντως, των θρησκευτικών μειονοτήτων και των θρησκευτικών ελευθεριών στην Τουρκία βρισκόταν στον πυρήνα τον συζητήσεων που είχε ο κ. Βαρθολομαίος και με τον πρόεδρο της Γερμανικής Δημοκρατίας Γιόακιμ Γκάουκ. Εξάλλου, ο κ. Γκάουκ στην ομιλία του κατά την πρόσφατη επίσκεψή του στην Τουρκία είχε αναφερθεί σε ζητήματα που σχετίζονται με τη λειτουργία της δημοκρατίας και με τα δικαιώματα του πολίτη, και οι αναφορές αυτές είχαν εξοργίσει τον Τούρκο πρωθυπουργό Ταγίπ Ερντογάν.
Τέλος, την αντίθεσή του στην πρόθεση του Τούρκου πρωθυπουργού εξέφρασε και ο συμπρόεδρος του Κόμματος των Πρασίνων, τουρκικής καταγωγής, Τζεμ Οζντεμιρ. «Δεν μπορώ να καταλάβω το νόημα μιας τέτοιας πρόθεσης. Η Τουρκία δεν υστερεί από τζαμιά – αντιθέτως. Πρόκειται μάλλον για μια χειρονομία ταπεινωτικού χαρακτήρα για τους χριστιανούς, για όλες τις μειονότητες της Τουρκίας. Η μετατροπή της Αγίας Σοφίας σε μουσείο από τον Κεμάλ Ατατούρκ ήταν κατά την άποψή μου ένα έξυπνο και σωστό μέτρο, το οποίο θα πρέπει να παραμείνει σε ισχύ. Και αν είναι να ανοίξει για θρησκευτικές λειτουργίες, τότε όχι μόνο για τους μωαμεθανούς, αλλά θα πρέπει και ο Πατριάρχης να έχει τη δυνατότητα να κάνει λειτουργίες» δήλωσε ο κ. Οζντεμιρ στην Deutsche Welle.
